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種豬的基因選種

　

吳明哲博士

行政院農業委員會畜產試驗所

　

一、摘要

　　台灣自國外引種，記錄性能後再選種及育種出新品種及新品系多年，近年來更進一步應用分子遺傳學工具來培育台灣種畜禽，這種基因選種技術包括基因檢測、性能評估及配種策略等三大項，有詳細的生產履歷及基因登錄資料，因此，運用基因選種技術是種畜禽性能改良的新趨勢。畜牧法第十七條「主管機關得派員檢查或檢驗種畜禽業者之種畜禽、種源、設備、血統登錄及有關紀錄，種畜禽業者無正當理由不得規避、妨害或拒絕。種畜禽及種源經前項檢查或檢驗，發現有法定傳染病或遺傳性疾病者，不得供繁殖用。」。第十七條是基因登錄、基因條碼及基因選種的法源。種豬生長性能檢定站及成豬體型比賽會每頭豬均進行基因檢測，檢測引起緊迫猝死的緊迫基因(AA, AB, BB)、控制排卵數量的多產基因(MM, MN, NN)、提高肉豬瘦肉率的增肌基因(FF, FG, GG)及增長基因(QQ, QR, RR)、以及影響到肌肉內的脂肪堆積分佈的肉質基因(HH6, HL5, HL4, HL3, LL2, LL1, LL0)，種豬場選留AA-MM-FF-QQ-HH6等有利基因型的種豬進行血統登錄及配種繁殖，種豬的基因選種目標不僅為增加遺傳穩定度及降低選種成本，也要提升種豬的國際競爭力及肉豬生產效率。

關鍵詞：基因條碼(DNA Barcode)、基因選種(Genomic Breeding)、種畜禽(Stock Breeding Animal)、性能檢定(Performance Test)、血統登錄(Pedigree Registration)。

　

二、種豬的血統登錄

　　 基因決定品質，品質吸引顧客。動物育種體系包括出生登記、性能檢定、種用登錄及種畜場評鑑等四大主軸。種畜禽產業是畜牧產業的火車頭，畜產先進國家無不重視種畜禽產業，重視種畜禽產業也才能使畜產業永續經營。台灣農業藉由資訊工具及生物科技研發之助，有機會把內銷型態的傳統農業轉型為「品種、品質、品牌」一體成型的上品農業，提高台灣農畜產品的國際行銷競爭力。

　　台灣種豬登錄系統建立於1975年，把自1971年出生的純種豬一一辦理血統登錄，包括純種豬杜洛克、約克夏、藍瑞斯、漢布夏種等四大國際品種的血統，也記錄追蹤種豬的性能表現，種豬登錄場代碼是以其所在地之郵遞鄉鎮區代碼三碼為前三碼，再依參加登錄先後給予01至99流水號，共五碼組成，例如竹南種豬檢定站為35008，新化種豬檢定站為71208，但冷凍精液進口公司則用000為前三碼。登錄系統於1983年有重大的突破，以電腦建立登錄場種豬血統，並於1998年配合網路養豬計畫上網於台灣畜產種原資訊網www.angrin.tlri.gov.tw，於2009年年初已累計登錄164,702頭種豬(表一)。為區分種豬檢定站取得的產肉能力登錄號，自1983年出生並在種豬檢定站取得產肉能力登錄之種豬，改以檢定站為登錄代碼(竹南站35008，新化站71208)，因此可以了解同年出生種豬有多少比例(表二)，具有生長性能檢測資料。近五年來，每年總登錄頭數約有4,000頭左右，其中有1,000頭以上是在種豬檢定站取得血統登錄號，顯示種豬場把新一代仔豬送檢的比例已增加，將有利於種豬群年輕化，加速遺傳改進速率。

　

表一、台灣種豬登錄資料

Table 1. Breed and gender statistics on breeding pig with pedigree registration

品種	性別	登錄頭數	登錄號(最初)	登錄號(最近)	出生年(最初)	出生年(最近)
Y	公 M	8161	000024	191540	1971	2008
Y	母 F	22812	000004	191653	1971	2008
L	公 M	13590	000043	191619	1971	2008
L	母 F	63294	000062	191654	1971	2008
H	公 M	773	000039	160380	1972	2001
H	母 F	857	000005	159585	1971	2001
D	公 M	19187	000016	191650	1971	2008
D	母 F	36028	000011	191655	1971	2008
Y		30973	000004	191653	1971	2008
L		76884	000043	191654	1971	2008
H		1630	000005	160380	1971	2001
D		55215	000011	191655	1971	2008
合計Total		164702	000004	191655	1971	2008

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/pigregbreed.asp)

　

表二、種豬登錄頭數及檢定登錄百分比

Table 2. Birth year and growth proved statistics on breeding pig with pedigree registration

種豬出生年	登錄總頭數	登錄場總數	登錄品種數	國外進口			登錄雄親數	登錄雌親數	檢定站登錄頭數	種豬場登錄頭數	檢定站登錄百分比	種豬場登錄百分比
				登錄頭數	登錄率(%)	場數
2008	1275	25	3	21	1.6	3	281	662	347	928	27	73
2007	3806	39	3	53	1.4	11	461	1642	1223	2583	32	68
2006	4274	42	3	88	2.1	13	547	1986	1107	3167	26	74
2005	4516	48	3	108	2.4	9	592	2169	1079	3437	24	76
2004	4208	55	3	186	4.4	17	546	2054	1003	3205	24	76
2003	4210	44	3	67	1.6	5	547	2066	959	3251	23	77
2002	3669	42	3	10	0.3	2	574	1944	450	3219	12	88
2001	4977	47	4	36	0.7	3	705	2492	843	4134	17	83
2000	5557	54	4	195	3.5	4	696	2620	610	4947	11	89
1999	5768	60	4	112	1.9	9	707	2683	663	5105	11	89
1998	5172	59	4	324	6.3	8	712	2402	541	4631	10	90
1997	3875	53	4	26	0.7	3	724	2129	210	3665	5	95
1996	6687	81	4	198	3.0	18	1013	3364	686	6001	10	90
1995	8325	97	4	585	7.0	37	940	3736	959	7366	12	88
1994	8272	102	4	202	2.4	33	1006	3922	907	7365	11	89
1993	7675	97	4	283	3.7	23	942	3737	521	7154	7	93
1992	6084	98	4	95	1.6	13	907	3260	549	5535	9	91
1991	6148	97	4	155	2.5	19	937	3242	491	5657	8	92
1990	5788	82	4	210	3.6	15	940	3192	541	5247	9	91
1989	6880	86	4	840	12.2	42	952	3340	593	6287	9	91
1988	7392	88	4	750	10.1	45	990	3349	519	6873	7	93
1987	6885	80	4	659	9.6	37	1018	3251	585	6300	8	92
1986	6459	77	4	411	6.4	27	986	3243	574	5885	9	91
1985	7159	86	4	307	4.3	20	1109	3511	690	6469	10	90
1984	7932	103	4	894	11.3	43	1087	3495	533	7399	7	93
1983	4305	102	4	992	23.0	62	831	2080	244	4061	6	94
1982	4202	101	4	860	20.5	58	741	2007	0	4202	0	100
1981	2924	91	4	835	28.6	55	572	1283	0	2924	0	100
1980	2932	78	4	663	22.6	38	538	1263	0	2932	0	100
1979	2061	69	4	358	17.4	25	460	932	0	2061	0	100
1978	2082	61	4	1019	48.9	45	308	588	0	2082	0	100
1977	1090	46	4	444	40.7	26	223	371	0	1090	0	100
1976	717	32	4	190	26.5	13	136	242	0	717	0	100
1975	786	29	4	384	48.9	24	82	135	0	786	0	100
1974	349	14	4	306	87.7	11	13	27	0	349	0	100
1973	160	8	4	138	86.3	7	1	3	0	160	0	100
1972	85	10	4	84	98.8	9	1	1	0	85	0	100
1971	16	6	4	14	87.5	5	0	0	0	16	0	100

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/pigregnew.asp)

　

　　讓種豬血統登錄資料上網(圖一)，使每人隨時隨地皆可查詢種豬系譜。因此於1996年畜產試驗所李世昌、蔡秀容、賴永裕、黃鈺嘉、吳明哲及張秀鑾等育種研究人員，開始自行撰寫程式及網頁，發展「網路養豬」資訊系統，諸如登錄頭數、送檢頭數、送檢場介紹、檢定豬親代性能的跨期別共同評估育種價等等，台灣大學宋永義教授、屏東科技大學張直教授、中央畜產會王旭昌、謝明學、林鴻霖、王受鎔、竹南種豬檢定站黎漢龍、種豬協會劉桂柱、現代養豬雜誌社李陵芳等一同參與，讓自1975年來的種豬血統登錄資料由個人電腦備份到網站，並逐步凝聚共識，共同推動豬種改良與促進養豬事業發展。不僅有助於社會大眾瞭解畜產種原近況和應採取的選育步驟，且可讓種畜場進行資訊交流工作，共同為畜產種原選育做更合理地規劃。網路養豬計畫也從1998年開始在農委會朱技正慶誠大力支持下開始規劃細部，包括要有教育性質的網路養豬會議之召開，也要陸續藉著網路養豬會議整合各項養豬資訊，介紹予養豬農友，也期望各位農友對逐項討論議題踴躍參與，並提供寶貴意見。

　

登錄號：113656 場代碼：35004

圖一、種豬血統登錄資料上網於台灣畜產種原資訊網站

Figure 1. Pig pedigree record on the web site of www.angrin.tlri.gov.tw

　

　　網路養豬會議於2000年1月28日第一次召開，從頭讓種豬場如何上網查種豬系譜、檢定成績、照片等開始，並教育養豬業界學習上網及建立自己的資料庫，了解網路養豬的優勢有六：(1)網路資訊是24小時隨時可查詢，是各行各業均可看到的資訊，是世界各國人士均可隨時隨地可看到的資訊。(2)網路資訊讓您的種豬圖片、資訊和推廣資料跟著您，您在任何有網路的村里辦公室就可展示給您的客戶和親朋好友的方法。(3)網路資訊可替我豬場的優良種豬身價(育種價)按繁殖性狀、生長性狀、肉質性狀和體格性狀逐一標示價差(比全台的平均多多少錢)。並進而跟其他種豬場的優良種豬合八字，使仔豬更能係出名門。(4)網路資訊可替我豬場的新生仔豬算命(估計育種價)，預估會長多少肉、生多少小豬或耐用多久! (5)網路資訊可替我豬場的優良種豬追縱其子孫在台灣或其他國家的分布和受到的歡迎狀況。(6)網路資訊可讓我的優良種豬成為台灣種豬DNA貯存庫(豬基選)的一份子，揚名國際。網路養豬第一次會議說明『檢定公豬期別查詢』與『網路養豬策略聯盟』兩個動態網頁，業者可以透過網際網路瞭解送檢豬隻的最新現況，並可同時查詢過去送檢豬隻之相關資訊。並介紹種公豬的外型照片已上網一年，以及把同一系譜的豬隻照片製成網頁供檢索。

　

三、種豬的選拔性狀

　　種豬成長中的日增重、飼料效率及背部脂肪厚度等三項性狀作為種豬性能檢定指數(表三、表四)。種豬性能檢定指數決定一頭種豬的死活，合格的種豬授予產肉能力登錄號。飼料效率(飼料量/增重)的高低影響到養豬戶的直接收益，因此，飼料效率為3.00時，毛豬每公斤的飼料成本將高達62%，這樣一來，養豬的利潤就降低很多。台灣種豬生長性能檢定工作自1975年開始，已有30年以上，使用檢定期間日增重、飼料效率及達110公斤體重的背脂厚度等三項組合成一個選拔指數，已讓種公豬達110公斤體重的日齡平均在150天以內，飼料效率在2.1以內，背脂薄瘦肉多，更讓台灣種豬成為亞熱帶國家的優質品系，1997年口蹄疫發生前曾大量外銷種豬至東南亞國家。

　

表三、新化檢定站種公豬日增重、飼料效率及背部脂肪厚度等三項性狀之改進

Table 3. Top records for daily gain, feed efficiency and backfat thickness at Hsinhua Station

新化檢定站 產肉能力登錄公豬 Growth Performance Registered Boar at Hsinhua Station
最早生公豬 The Earliest Born Boar: 2000/2/15 最晚生公豬 The Latest Born Boar: 2008/12/19										共計 Off-Test Boars in Total: 3639 頭 Head 來自幾家種豬場 Provided by: 33 家 Farms
出生年 Year of Birth	品種 Breed	公豬 頭數 No. of Boar	雄親 頭數 No. of Sire	種畜 場數 No. of Farm	達110公斤 日齡 Age to 110 kg, day		日增重 ADG, kg		飼料效率 FE (feed/Gain)		背脂厚度 BF Thickness, cm		選拔指數 Selection Index		絕對指數 Performance Index		同胎仔豬數 Litter Size
					最少 Earliest	平均 A110 Mean	最大 Greatest	平均 ADG Mean	最好 Best	平均 FE Mean	最薄 Thinnest	平均 BF Mean	最高 Highest	平均 Index Mean	最高 Highest	平均 Index Mean	最多 Largest	平均 LS Mean
2008	D	308	97	20	124	148.7	1.421	1.097	1.93	2.056	1.07	1.244	140	111.1	260	242.6	14	10.0
2007	D	278	80	16	128	146.5	1.329	1.094	1.95	2.041	1.07	1.232	138	110.4	262	243.5	16	10.0
2006	D	295	94	16	125	147.6	1.312	1.075	1.90	2.031	0.90	1.222	136	111.2	261	243.3	18	10.0
2005	D	278	98	18	127	148.6	1.389	1.063	1.92	2.031	1.00	1.224	141	112.7	269	242.5	16	10.0
2004	D	224	77	15	121	149.3	1.390	1.056	1.90	2.038	1.03	1.217	130	107.7	267	242.1	15	10.0
2003	D	209	57	15	125	148.7	1.250	1.040	1.90	2.061	1.02	1.224	125	106.7	258	239.8	16	10.0
2002	D	179	61	17	128	148.9	1.300	1.046	1.93	2.090	1.10	1.276	134	108.4	260	236.7	16	10.0
2001	D	228	89	18	126	150.2	1.208	1.017	1.93	2.123	1.08	1.304	128	106.9	254	232.4	16	10.0
2000	D	208	80	19	123	156.2	1.382	1.020	1.95	2.117	1.04	1.370	128	105.9	253	229.9	15	10.0
2008	L	121	47	16	124	144.9	1.407	1.100	1.97	2.054	1.09	1.237	158	113.5	296	256.4	15	11.0
2007	L	144	51	16	120	142.6	1.357	1.124	1.86	2.046	1.05	1.234	145	113.3	293	260.0	16	11.0
2006	L	140	50	17	120	143.1	1.329	1.102	1.91	2.030	1.09	1.234	141	114.2	292	257.6	16	11.0
2005	L	127	45	16	126	142.1	1.357	1.113	1.92	2.045	1.01	1.210	145	115.0	297	259.5	19	11.0
2004	L	118	44	14	121	143.7	1.357	1.128	1.91	2.037	1.04	1.227	147	113.9	295	261.1	16	11.0
2003	L	156	47	15	120	141.7	1.492	1.134	1.73	2.061	1.01	1.224	167	115.6	317	261.0	18	12.0
2002	L	109	38	15	120	144.4	1.461	1.104	1.88	2.086	1.05	1.296	162	117.3	301	253.2	16	11.0
2001	L	82	36	14	126	142.6	1.471	1.105	1.94	2.116	1.10	1.288	158	117.7	313	252.5	16	11.0
2000	L	125	47	16	120	149.0	1.357	1.082	1.94	2.091	1.08	1.349	150	113.8	288	248.0	16	11.0
2008	Y	49	21	9	133	145.4	1.321	1.131	1.96	2.067	1.1	1.251	140	113.7	282	259.2	17	11.0
2007	Y	37	18	8	127	142.4	1.299	1.117	1.96	2.058	1.1	1.242	132	114.6	281	258.3	15	11.0
2006	Y	31	19	10	133	146.0	1.314	1.124	1.94	2.043	1.14	1.262	138	115.8	289	258.9	16	10.0
2005	Y	42	20	8	133	146.4	1.214	1.071	1.95	2.035	1.10	1.249	138	111.8	279	252.7	15	10.0
2004	Y	33	17	8	132	150.4	1.260	1.065	1.93	2.055	1.15	1.271	142	113.3	281	250.5	15	10.0
2003	Y	34	18	8	141	154.7	1.190	1.053	1.96	2.079	1.14	1.293	129	109.9	267	247.0	14	10.0
2002	Y	19	11	6	137	149.4	1.167	1.065	1.98	2.113	1.17	1.349	125	114.5	264	245.1	14	10.0
2001	Y	29	14	8	140	152.2	1.286	1.066	1.98	2.103	1.21	1.359	138	112.6	269	245.1	15	10.0
2000	Y	36	18	8	126	152.3	1.357	1.063	1.95	2.095	1.17	1.372	152	115.3	281	244.5	13	10.0

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/bsdmphotogene4.asp)

　

表四、竹南檢定站種公豬日增重、飼料效率及背部脂肪厚度等三項性狀之改進

Table 4. Top records for daily gain, feed efficiency and backfat thickness at Zhunan Station

竹南檢定站 產肉能力登錄公豬 Growth Performance Registered Boar at Zhunan Station
出生年 Year of Birth	品種 Breed	公豬 頭數 No. of Boar	雄親 頭數 No. of Sire	種畜 場數 No. of Farm	最早生公豬 The Earliest Born Boar: 2000/5/8 最晚生公豬 The Latest Born Boar: 2007/11/27						共計 Off-Test Boars in Total: 2643 頭 Head 來自幾家種豬場 Provided by: 26 家 Farms
					達110公斤日齡 Age to 110 kg, day		日增重 ADG, kg		飼料效率 FE (feed/Gain)		背脂厚度 BF Thickness, cm		選拔指數 Selection Index		同胎仔豬數 Litter Size
					最少 Earliest	平均 A110 Mean	最大 Greatest	平均 ADG Mean	最好 Best	平均 FE Mean	最薄 Thinnest	平均 BF Mean	最高 Highest	平均 Index Mean	最多 Largest	平均 LS Mean
2007	D	323	86	15	121	141.0	1.321	1.148	1.91	2.114	1	1.311	169	118.0	15	10.0
2006	D	331	89	15	126	143.0	1.346	1.176	1.75	2.099	1.20	1.332	167	125.0	16	10.0
2005	D	283	91	15	122	140.0	1.377	1.215	1.66	1.996	1.18	1.322	171	126.0	15	10.0
2004	D	264	91	15	121	142.0	1.415	1.174	1.51	1.906	1.06	1.296	185	123.0	15	10.0
2003	D	157	63	15	123	148.0	1.449	1.141	1.58	1.991	1.03	1.273	151	116.0	16	10.0
2002	D	42	24	9	131	148.0	1.34	1.120	1.68	1.968	1.18	1.360	140	112.0	15	11.0
2001	D	215	89	14	121	147.0	1.429	1.131	1.52	2.096	1.07	1.348	158	114.0	15	10.0
2000	D	114	54	14	132	147.0	1.321	1.121	1.80	2.172	1.03	1.314	137	110.0	16	10.0
2007	L	102	39	12	122	135.0	1.34	1.205	1.9	2.071	1.15	1.297	152	119.0	18	11.0
2006	L	111	52	14	122	137.0	1.367	1.228	1.73	2.014	1.26	1.348	152	123.0	16	11.0
2005	L	108	48	13	122	134.0	1.388	1.267	1.64	1.905	1.18	1.357	169	130.0	18	11.0
2004	L	131	54	14	115	134.0	1.571	1.245	1.50	1.842	1.13	1.361	172	125.0	16	11.0
2003	L	124	43	14	121	138.0	1.530	1.244	1.48	1.906	1.02	1.299	171	123.0	17	12.0
2002	L	11	7	5	133	139.0	1.408	1.220	1.65	1.852	1.14	1.346	153	121.0	18	12.0
2001	L	88	46	14	119	140.0	1.449	1.205	1.64	1.997	1.12	1.333	165	122.0	16	11.0
2000	L	39	30	12	124	141.0	1.365	1.183	1.76	2.053	1.13	1.323	166	118.0	15	11.0
2007	Y	30	19	9	124	136.0	1.304	1.210	1.99	2.073	1.26	1.331	138	116.0	14	10.0
2006	Y	40	21	8	121	137.0	1.340	1.238	1.82	2.053	1.24	1.363	152	122.0	15	11.0
2005	Y	42	24	6	124	137.0	1.367	1.238	1.71	1.950	1.26	1.383	171	132.0	16	10.0
2004	Y	36	21	10	125	141.0	1.408	1.188	1.57	1.898	1.26	1.376	167	129.0	14	10.0
2003	Y	23	17	8	119	146.0	1.457	1.164	1.70	2.078	1.19	1.355	163	117.0	14	10.0
2002	Y	3	2	2	143	149.0	1.214	1.165	1.93	1.967	1.24	1.283	124	120.0	14	13.0
2001	Y	20	11	6	125	145.0	1.365	1.142	1.79	2.101	1.22	1.370	150	121.0	16	11.0
2000	Y	6	6	3	137	148.0	1.167	1.113	1.97	2.125	1.31	1.423	133	120.0	12	10.0

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/bsdmphotogene4.asp)

　

　　我們稱飼料效率值在2.00以內的種豬為「高飼效種豬」(圖二)。新化檢定站之高飼效種豬(截至2009/07/29)最佳的飼料效率在杜洛克、約克夏、藍瑞斯種公豬分別有1.90、1.93、1.73之成績，新化檢定站女豬有個別檢定，在杜洛克、約克夏、藍瑞斯種女豬分別有1.95、1.92、1.95之成績。竹南檢定站種豬最佳的飼料效率在杜洛克、約克夏、藍瑞斯種公豬分別有1.51、1.57、1.48之成績。因此使用這種高飼效種豬於肉豬生產上，可降低飼料使用量，讓每頭肉豬少吃50公斤飼料，可節省515元，年產700萬頭肉豬的養豬業，可節省36億元的飼料費。

　

新化檢定站高飼效種豬D、Y、L公豬第一名
暉煌D0329-05亞鶴 (FE=1.90)	福昌Y0053-04冠瀚 (FE=1.93)	暉煌L0769-14合絆 (FE=1.73)
新化檢定站高飼效種豬D、Y、L女豬第一名
福昌D0634-11冠潔 (FE=1.95)	仙佳Y0376-05亞秀 (FE=1.92)	福昌L0279-10亞岑 (FE=1.95)
竹南檢定站高飼效種豬D、Y、L公豬第一名
順安D0785-01冠群 (FE=1.51)	福昌Y0070-01冠財 (FE=1.57)	暉煌L0727-11冠輝 (FE=1.48)

圖二、新化檢定站及竹南檢定站之高飼效種豬

Figure 2. Best feed efficiency of pigs on Hsinhua Station and Zhunan Station

　

　　種豬檢定站以同期比較差方式，設定L, Y, D, H等四大品種豬隻之背脂厚度、日增重及飼料效率的三性狀選拔指數，促使種公豬選拔目標是增加肉豬的肌肉量，重視屠體瘦肉率提昇是養豬業及加工業的共同目標。近年來，黑豬飼養業者也曾要求設立黑豬檢定站，盤克夏豬種(B)及畜試黑豬一號(E)自成另一登錄系統辦理。而竹南檢定站的黑豬(F)則尚未有登錄系統辦理。

　　種女豬的購買價格每頭8,000元平均，年更新90,000頭，其產值達7.2億元。台灣區種豬產業協會會員場提報種豬配種記錄、小豬出生記錄到中央畜產會登錄系統，再分批送小豬到南北兩個檢定站參加生長性能檢測，最優60%的合格豬再辦理產肉能力登錄及基因登錄，留在場內長大的年輕種豬會參加種豬協會體型比賽拍賣會。種豬拍賣分別於台南新化及苗栗竹南的種豬拍賣館進行，拍賣會自中午12:30至下午3:30，每次有60~70頭種豬出場拍賣，平均每頭售價25,000元，約是肉豬價的五倍以上，但種豬最高價有701,500元。種豬供應體系產生的育種資料庫、基因庫及數位影片均可上網查看，由畜產試驗所整合屏東科技大學、台灣動物科技所、中央畜產會等基因檢驗平台，讓每頭種豬擁有生產履歷表及基因條碼，並估計每頭種豬的基因貢獻度。

　　畜試所網路養豬暨基因選種計畫定期公佈新化檢定站、竹南檢定站、種豬協會比賽會等三個單位每期種豬拍賣價格最高價，並由現代養豬雜誌社提供種豬照片上網，從1999年11月至2009年7月期間，杜洛克種公豬最高拍賣價701,500元(竹南站種名號175969冠俊，福昌D0490-02於2004/11/27出生)、藍瑞斯種公豬最高拍賣價521,000元(新化站種名號175704亞篙，祝興L1997-09於2004/12/18出生)、約克夏種公豬最高拍賣價151,000元(新化站種名號181929冠普，泰宏榮Y0996-01於2006/06/13出生)。近五年來，一頭基因登錄種公豬之後代拍賣總價(圖三)，就是財產收入總歸戶到種公豬一頭上，杜洛克品種最高已有1258萬元紀錄、藍瑞斯品種最高有407萬元紀錄、約克夏品種最高有95萬元紀錄，平均每頭種公豬年產值30萬元。

　

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigfarm/sales_price_rank.asp)

圖三、基因登錄種公豬之後代拍賣總價

Figure 3. Total sales of offspring in three major auctions for genotyped boar

　

四、種豬改良的基因檢測

　　種豬的遺傳物質如同數位存在於體染色體、性染色體及粒線體，以去氧核糖核酸(DNA)方式存在，在細胞核內的體染色體DNA及性染色體DNA成線狀，而在細胞質的粒線體內DNA則成環狀。DNA是由核甘酸的單體物(俗稱鹼基，英稱Base pair, bp)所組成，每一個核甘酸均由磷酸、五碳糖及四個氮鹽基中的一個組合而成。四個氮鹽基中，腺嘌呤(A)和鳥糞嘌呤(G)二者是屬於嘌呤族；胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)二者則屬於嘧啶族。DNA雙股裡，A和T以兩個氫鍵相吸，而G和C以三個氫鍵相吸。在DNA的單股序列中，含編碼區域(通稱Exon)與未編碼區域(通稱Intron)。編碼區域的DNA序列能被轉譯成蛋白質，這些蛋白質具有生理功能；未編碼區域的DNA序列則無法轉譯出蛋白質，然此區域含有大量的遺傳變異度，會影響基因表現，正可用以區別個體間的遺傳差異性。家豬(染色體2n=38)的分類學名為豬屬馴化豬種(Sus scrofa domestic)，是由歐亞野豬(染色體2n=36)演化而來，歸屬於豬科(Suidae)、豬亞目(Suiformes)和偶蹄目(Artiodactyla)。台灣地區豬種(圖四)依五月齡體重大小，可分為100公斤重的大體型豬種─藍瑞斯、約克夏、杜洛克與盤克夏；50公斤重的中體型豬種─桃園；和20公斤重的小體型豬種─蘭嶼。將豬38條染色體上的遺傳基因所在位置繪集成地圖─「豬基因圖譜」，再瞭解這許多基因在豬隻性狀上所扮演的功能，可選留具優質基因之種豬。利用基因檢測來選擇種豬，並依基因型組合來配種，孕育出來的種豬就是「基選豬」。

　

圖四、台灣地區豬種

Figure 4. Breed of pigs in Taiwan

　

　　基因決定品質，品種性能改進之新方向是基因檢測及基因選種。藍瑞斯、約克夏和杜洛克豬種於民間種豬場與種豬檢定站，均會有每頭種豬的血統登錄證明書。種豬檢定站完檢出售的每頭豬均進行基因登錄，檢測引起緊迫猝死的緊迫基因(AA, AB, BB)、控制排卵數量的多產基因(MM, MN, NN)、提高肉豬瘦肉率的增肌基因(FF, FG, GG)及增長基因(QQ, QR, RR)、以及影響到肌肉內的脂肪堆積分佈的肉質基因(HH6, HL5, HL4, HL3, LL2, LL1, LL0)，這五種基因檢測是DNA序列之單點鹼基差異，會引起豬隻生理生化上的功能差異，而影響到生產效率。台灣自國外引種，記錄性能後再選種及育種出新品種及新品系多年，近年來更進一步應用分子遺傳學工具來培育台灣種畜禽，這種基因選種技術包括基因檢測、性能評估及配種策略等三大項，有詳細的生產履歷及基因登錄資料，因此，運用基因選種技術是種畜禽性能改良的新趨勢。畜牧法第十七條「主管機關得派員檢查或檢驗種畜禽業者之種畜禽、種源、設備、血統登錄及有關紀錄，種畜禽業者無正當理由不得規避、妨害或拒絕。種畜禽及種源經前項檢查或檢驗，發現有法定傳染病或遺傳性疾病者，不得供繁殖用。」。第十七條是基因登錄、基因條碼及基因選種的法源。

　　 基因是生命體的骨架，飼養環境是保障基因功能的再現，而人為選育的投入是追求品質穩定度及生產效益提昇。種豬源頭管理所需的基因條碼包括體染色體、性染色體及粒線體等基因的生物商標註冊，使用基因序列的差異來編碼，主要是位序上的單一鹼基比較及特定鹼基序列的重複。種豬檢定站及種豬協會等定期拍賣豬，規定藍瑞斯及約克夏等母系品種之緊迫基因型要AA型，杜洛克當終端公豬品種之緊迫基因型不能有BB型，避免產生帶有BB型肉仔豬誕生，形成生長期間的斃死豬。因此，有基因登錄種豬受到青睞居多。

　　控制排卵數量的豬隻動情素受體 (Estrogen Receptor, ESR) 基因座位於第一對染色體短臂上，具有兩個交替基因A和B。ESR基因型為BB之母豬較AA型者，每胎分別可多分娩1.5與1.0頭以上仔豬與活仔豬，故亦將ESR基因座之B交替基因稱為多產基因(為避免與緊迫基因代碼B混淆，故產業應用上改稱M)。台灣藍瑞斯 (L)、約克夏 (Y)、杜洛克 (D)、梅山豬 (M)、桃園豬 (T)、盤克夏 (B)、蘭嶼豬 (U)、花色豬 (S)、迷彩豬 (T) 與畜試黑豬一號 (E)各品種ESR基因型為MM型之頻率分別為L/0.3%、Y/26.6%、D/0.0%、M/100%、T/81.6%、B/1.0%、U/16.9%、S/10.8%、T/31.0%與E/1.9%；多產基因M頻率則在上述各品種分別為0.05、0.51、0.00、1.00、0.83、0.01、0.43、0.46、0.50與0.16。杜洛克種未發現多產基因M之個體。

　　基因登錄的種豬，部份會成為種豬場的新血輪，有利於基因交流及重組，故持續提供新的基因信息及基因條碼等資料(表五)，將會帶動種豬場精益求精，促使其每頭種豬發揮優質基因，降低養豬戶生產成本，獲取最大的經營利潤。目前在中央畜產會及台灣區種豬產業協會的產業轉型計畫下，基因檢測工作分由畜產試驗所、台灣動物科技所、屏東科技大學畜產系遺傳育種研究室、中央畜產會屏東服務中心進行，檢測結果利用網路直接輸入資料庫，一年檢測5000頭以上。畜產試驗所也把基因序列數位化後，轉成種豬基因條碼系統，讓種豬選種精準度提高。

　

表五、緊迫基因登錄的種豬基因條碼檢測進度

Table 5. Status of DNA barcoding for breeding pigs with pedigree registration

品 種	出生 年	血統 登錄 頭數	種用 公豬		緊迫基因 登錄種公豬		種 公豬 後代 頭數	緊迫基因		多產基因		肉質基因		增肌基因		增長基因
			頭 數	種 用率	頭 數	基因 登錄率		頭數	檢測 率	頭數	檢測 率	頭數	檢測 率	頭數	檢測 率	頭數	檢測 率
D	2007	793	78	9.8	50	64.1	372	369	99.2	367	98.7	326	87.6	326	87.6	326	87.6
D	2006	832	86	10.3	66	76.7	862	856	99.3	739	85.7	733	85.0	647	75.1	647	75.1
D	2005	918	134	14.6	103	76.9	1489	1488	99.9	1245	83.6	1221	82.0	724	48.6	708	47.5
L	2007	328	42	12.8	25	59.5	278	271	97.5	229	82.4	246	88.5	241	86.7	241	86.7
L	2006	372	40	10.8	20	50.0	425	425	100.0	379	89.2	379	89.2	351	82.6	351	82.6
L	2005	325	52	16.0	33	63.5	829	827	99.8	653	78.8	659	79.5	470	56.7	457	55.1
Y	2007	123	14	11.4	11	78.6	40	39	97.5	39	97.5	36	90.0	36	90.0	36	90.0
Y	2006	127	27	21.3	15	55.6	299	298	99.7	275	92.0	263	88.0	230	76.9	231	77.3
Y	2005	144	15	10.4	9	60.0	102	101	99.0	76	74.5	74	72.5	53	52.0	48	47.1

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigbase/bsdquerysreg.asp)

　

　　種豬場辦理種豬比賽的每頭豬均進行基因登錄，進一步分析基因價差(表六、表七)。杜洛克種豬的緊迫基因AA型比AB型的拍賣成交價多4000~5000元之多，顯示緊迫基因選種後所生的肉豬收益不同，因此購買種豬的價格會有價差，同樣也有高肉質基因、多產基因及增肌基因等基因價差存在，因此讓有利基因型種豬行銷，會讓肉豬業者獲利。

　

表六、杜洛克種豬的緊迫基因型價差

Table 6. Price difference for genotype of stress gene Hal-1843 in Duroc boars

種豬 出生年	性別	緊迫 基因型	新化檢定站			竹南檢定站			種豬協會			總計
			成交 頭數	成交價格 平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格 平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格 平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格 平均(元)
2008	公	AA	233	46965	159000				153	36496	188000	386	42815
2008	公	AB	28	36285	119000				22	27863	71000	50	32579
2007	公	AA	218	36740	148000	253	38891	250000	178	32685	173000	649	36466
2007	公	AB	27	33592	88000	34	34544	93000	28	31428	70000	89	33274
2006	公	AA	222	37157	160000	275	33101	215500	141	33226	201000	638	34539
2006	公	AB	34	26911	81000	28	24446	55000	35	30457	202000	97	27478
2005	公	AA	189	48283	283000	252	43317	386500	141	37929	281000	582	43624
2005	公	AB	34	30147	74000	43	51465	292500	49	46204	700000	126	43666
2004	公	AA	156	47185	661500	238	47151	701500	153	35973	258000	547	44034
2004	公	AB	52	38086	130000	46	35739	193000	69	32608	176000	167	35176
2003	公	AA	142	41411	151000	175	50751	423500	99	36377	200000	416	44142
2003	公	AB	53	39292	113000	57	45710	221000	86	35151	152000	196	39341

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigbase/Price_Duroc_PSS.asp)

　

表七、種豬的緊迫基因AA型之肉質基因價差

Table 6. Price difference for genotype of meat quality gene HFABP in stress free boars

種豬 品種	性別	緊迫基因型	肉質基因型	新化檢定站			竹南檢定站			種豬協會			總計
				成交 頭數	成交價格平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格平均(元)	最高 價格(元)	成交 頭數	成交價格平均(元)
D	公	AA	HH6	833	43968	661500	60	53308	205000	569	38998	281000	1462	42417
D	公	AB	HH6	128	33816	119000	16	49718	101500	128	34156	202000	272	34911
D	公	AA	HL	308	40123	283000	39	46089	153500	205	28092	101000	552	36076
D	公	AB	HL	87	35977	130000	16	38250	92500	90	39855	700000	193	37973
D	公	AA	LL	19	30763	54000	8	51687	130500	5	20800	35000	32	34437
D	公	AB	LL	13	35961	113000	1	29500	29500	4	26000	50000	18	33388
L	公	AA	HH6	4	61250	162000				2	68500	93000	6	63666
L	公	AA	HL	475	34191	521000	49	34397	301000	231	36101	260000	755	34788
L	公	AA	LL	125	34396	125000	20	29675	151000	60	35033	152000	205	34121
Y	公	AA	HH6	1	15000	15000							1	15000
Y	公	AA	HL	79	36253	151000	6	31916	72500	42	25785	61000	127	32586
Y	公	AA	LL	82	35530	143500	6	29833	73000	44	27409	110000	132	32564

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigbase/Price_Duroc_PSS.asp)

　

五、基因選種商機

　　 畜試所、中央畜產會及屏科大輔導台灣區種豬產業協會各種豬場的種豬比賽會評選合格種豬，進行高肉質基因檢測與基因驗證，使優質種豬的產肉遺傳特色普遍應用於肉豬場，提高豬肉之品質與附加價值。把種豬發展轉型為一種高科技應用的基因選種產業。進一步，把種豬血統登錄、性能檢定及拍賣成績的結合成種豬育種資料庫，並藉由基因選種技術來改進種豬性能及挑選優質種豬，協助養豬場突破生產效率瓶頸，讓農民再生養豬致富經濟契機。自2005年以來，台灣區種豬產業協會會員場總共飼養700頭優質公豬參加畜試所網路養豬暨基因選種計畫，約計每年有2億元以上的種豬銷售值。

　　網路養豬資料庫(www.angrin.tlri.gov.tw)有圖像、文字、影像、語音等資料(圖五)，運用資訊科技加以數位化，並整合運用服務養豬業，提供新化種豬檢定站及竹南種豬檢定站之產肉能力登錄種公豬的性能平均。產肉能力登錄種公豬飼效上，亦逐年降至2.00以內，竹南站的種公豬飼效(1.95)比新化站種公豬飼效(2.05)還好，我們稱飼效值在2.00以內的種豬為「高飼效種豬」。台灣早在1975年就重視杜洛克、藍瑞斯、約克夏種公豬飼料效率的檢定工作至今，台灣種公豬40至110公斤體重成長期之飼料效率(飼料量/增重)由30年前的3.17提昇為2.05，而2010年目標值為2.00以內。種豬因1997年口蹄疫病而無法外銷。期望未來，台灣種豬能再度出口。

　

圖五、網路養豬圖像、文字、影像、語音等資料庫

Figure 5. Web based photo and movie for genomic breeding pigs

　

　　 數位經濟時代的產業發展環境，不論個體及企業皆會藉由知識網路化的投入來創造財富，不論是參與者、動態關係、遊戲規則，以及所有的生存或成功要件都迥異於以往。同時，遊戲規則的改變也開始影響企業的商業行為、工作模式、遊樂休閒、生活方式，甚至可能影響到人類的思考模式。種豬產業的數位經濟有賴於種豬場的生產履歷表網路化及資料掌上化系統之推動。台灣種豬選育的範圍無邊無際，決非一般的國外引種或個人種豬場、登錄機構、檢定站、基因檢測研究室、體型比賽會等所可涵蓋，甚至豬肉分切及肉品加工，與豬舍建築、飼料、衛生安全有關的廠商，亦應屬其內;更重要的國際市場資訊與消費者間之訊息溝通，是主導種豬性能改進的二大要因，如能掌握，則未來幾年全球種豬貿易要角，台灣仍然是熱帶型種豬的輸出國。基於此，讓種豬產業有數位化服務內涵，有利於培養新一代的養豬達人。

　　 對種豬產業而言，面對數位經濟時代的經營環境，重新檢討現有的事業領域與核心競爭優勢是必要的，如種豬育種研究單位應考慮整合數位服務與資訊內容事業的可行性，而其他產業則應評估種豬產業所需之熱門種豬供應鏈(圖六)的可能轉變方向，評估生產履歷表資料建檔外包、種豬影片委託上網、或是利用多媒體體系為種豬行銷服務的可能性。不論是現場交易、電子商務、電子資料交換或快速回應，均須要有健全的種豬運銷管理系統相配合，因此種豬產業界應積極從事種豬運銷管理工作，如減少不必要的業務與手續、建立平行且同步處理多項作業程序、普遍設立種豬配銷需求分佈系統、減少不具經濟價值的在養種豬數量、善加利用農政單位的研發等公共設施、善加利用育種資料庫之網路程式，預先管理在養種豬的配種分娩流程等。值得注意的是，由於種豬場與客戶之互動增加，種豬產業之相關廠商不論在產品設計或售後服務上，均應更重視肉豬場、加工廠、以及後端消費者的即時資訊需求，會要求生產報表及資訊更公開化。

　

(http://pigbase.angrin.tlri.gov.tw/pigbase/bsdquery8HAZ.asp)

圖六、熱門種豬供應鏈

Figure 6. Stock supply chain from web based genomic registered pig

　

　　長遠來看，台灣的種畜(豬牛羊)與種禽(雞鴨鵝)生產體系會引進、評估與研發修正新興的分生及資訊技術，輔助種畜禽性能改進與本土家畜禽遺傳鑑定，期供作民間種畜禽業者提升其牧場經營效率用。經濟育種上，依產業別整合具重要經濟價值之全國種畜禽遺傳資源，成為大型國家級核心種畜禽族群，加速全國種畜禽同步改良腳步與提高產業競爭力。加強全國種畜禽育種資料庫與資訊網路之方便性，達到優良種畜禽重要經濟性狀國際評比與國內排名之實用目標。結合分生技術與數量遺傳學原理於選種技術之應用，建立遺傳標記輔助選拔系統，且逐步將重要遺傳標記納入種畜禽登錄系統，建構完整之種畜禽遺傳育種資訊。SNP基因條碼是以ATGC為代碼，UTR基因條碼以2至9的重複序列數，利用台灣種母畜禽會有一個粒線體基因條碼的母性基因遺傳特性，後代也會有母親的基因條碼，再加上體染色體的多項基因型，組成個體動物的基因型代號串聯，進而基因登錄於血統登錄資料庫，研發出一套國家用種畜禽生產履歷及基因條碼整合應用系統，設置於www.angrin.tlri.gov.tw網站上，協助台灣種畜禽生產業者及出口業者行銷臺灣優質畜禽，並培育熱帶型優質品種及品系，建立進口種原管理、種畜禽驗證監控及技術平台。

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