台灣畜產種原知識庫是一個高度可擴充、具物件導向、且易於使用的動態網站內容管理系統(CMS)，採用 PHP 語言來設計。

主選單的內容包括：
●最新消息 (News)：提供最新畜產相關新聞、檢定站相關新聞及研討會、會議訊息。
●行事曆 (Calendar)：包含種豬檢定行事曆、台灣乳牛平均性能指標系統、畜產生物多樣性、遺傳育種組、家禽…等行事曆。
●種原文件(Documents)：依物種做分類，包含會議記錄、計畫、辦法、法規、要點、資料…。
●期刊(Magazine)：裡面包括檢定公(母)豬期別、中國畜牧、農牧旬刊、畜牧半月刊、現代養豬、中國畜牧學會會誌等內容。
●種原圖庫(Angrin Album)：對圖片做內容介紹，依物種分類讓使用者能輕易找到所需的圖片。
●多媒體(Multimedia)：依物種分類，內容有動物(豬、牛、羊、雞、鴨、鵝…)的聲音檔、影像檔、影音檔，目前以種豬拍賣過程的影片佔最大宗。
●種原下載 (Download)：放置一般常用軟體工具，及會議簡報資訊等。
●RSS (RSS)：可提供使用者依所需要的文件類別訂閱RSS。提供RSS的資訊有：最新消息、種原文件、網站連結。
●網站連結 (Website)：與畜產相關的網站、機關做連結。
●線上書藉(WebBook)：目前有兩本使用手冊(種原知識庫使用手冊、資訊網管理系統使用手冊。

出版刊物內容包括：
●專輯：種原相關的書籍。
●雜誌：酪農天地、羊協一家親、酪協月刊等等。
●書刊及手冊：種原推出的一些刊物及手冊、法規等等。

首頁的版面有：
左邊版面：
●新聞分類：可以選擇使用者需要的相關新聞。
●行事曆：點擊進去可以看到當月的行程表。
●隨機期刊文章：有關期刊的文章文，以隨機的方式呈現。
●期刊-人氣排行：期刊中最多人觀看的文章會在此區排列出來。

中間版面：
●最新消息：提供最新上網的消息五則，不分物種。
●最新種原文件：提供最新上網的種原文件。
●期刊-新進文章：有關期刊中最新上網的文章。
●種原最新下載：可下載所需工具、軟體或簡報。
●熱門照片：種原圖庫中點擊率最高、最多人觀看的照片。
●新進照片：種原圖庫中最新上網的三張照片。

右邊版面：
●電子相簿：會隨機秀出種原圖庫裡面的照片。
●搜尋(Search)：當使用者輸入一個關鍵詞做資料查詢時，搜尋系統會用這個搜尋詞到搜尋資料庫中比對，並且經過一些相關度的運算之後，依照相關程度將網頁做排序，將日期愈近的資料排在愈前面。
●夥伴網站(Partner)：連結與種原中心有密切配合的網站，目前有台灣畜產種原資訊網、畜產生物資訊庫、行政院農業委員會、中央畜產會的網站。
●熱門連結網站：裡面包含網站連結裡面最多人點擊的網站。
●隨機小語：會秀出偉人的名言、名錄。