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5-4 田間試驗結果 5-5 DNA指紋分析 6 飼養管理及衛生防疫措施
DNA指紋分析

5-5 DNA指紋分析

  黃等(2006)採集青殼蛋選育品系第二代產青、白殼蛋母菜鴨各10隻血樣,進行DNA萃取後,利用螢光增殖片段長度多態性(amplified fragment length polymorphism, AFLP)、逢機增殖多態性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)及逢機增殖微衛星多態性(random amplified microsatellite polymorphisms, RAMPO)之DNA指紋技術,分析產青與白兩種不同蛋殼顏色褐色母菜鴨DNA指紋之差異。於AFLP試驗分析之結果顯示,利用12組篩選引子組合可於青、白殼組鴨隻基因組DNA中分別增殖出217和218條多態性環帶,平均多態性訊息含量(polymorphism information content, PIC)分別為0.28與0.29;利用T+AAG/E+ACA引子組合可於產白殼蛋組鴨隻AFLP指紋中發現一片段長度為200 bp特有波峰;於RAPD試驗分析之結果顯示,青、白殼兩組鴨隻之平均共有環帶頻率分別為0.88與0.87,相似性及遺傳距離分別為89.37%及0.17(表7);利用OPAL-03引子可於產白殼蛋組鴨隻RAPD與RAMPO指紋態樣中之2.2 kb處產生一條明顯之環帶,利用OPAG-07引子可於產青殼蛋組鴨隻RAMPO指紋中產生一條約1.5 kb之明顯環帶,顯示青、白殼兩組鴨隻中之DNA指紋態樣具有差異性(圖10)(黃等,2006)。此些DNA片段可能與褐色菜鴨蛋殼顏色相關性狀有關係,有利於進一步探討RAPD與RAMPO指紋態樣與菜鴨蛋殼顏色之遺傳訊息。
                           
                          
表7. 以12 組引子分析產青殼和白殼蛋褐色母菜鴨間AFLP之指紋多態性
                           
SetSelective ex tension  No.Polymorphic marker PIC
TaqEcoRLabel dye TSGETSWE TSGETSWE
1AACAAAHEX 2323 0.270.27
2AACAACNED 1517 0.300.27
3AACACAFAM 1918 0.220.32
4AAGAAAHEX 2723 0.310.25
5AAGAACNED 1111 0.360.35
6AAGACAFAM 2122 0.280.23
7AATAAAHEX 2223 0.250.29
8AATAACNED 87 0.290.18
9AATACAFAM 1616 0.330.32
10ACAAAAHEX 2123 0.240.31
11ACAAACNED 1011 0.250.33
12ACAACAFAM 2424 0.210.30
Meanvalue 18.0818.170.280.29


PIC: Polymorphism information content.多態訊息量
TSGE: 產青殼蛋褐色菜鴨
TSWE: 產白殼蛋褐色菜鴨 (黃等,2006)
                               
圖10. 以逢機引子增殖青殼與白殼褐色母菜鴨基因組DNA之RAPD(A)及RAMPO(B)指紋圖譜。膠片上之PCR產物經南方吸漬後係與32P-dCTP標幟之(TG)6探針雜交。青色蛋殼,lanes: 1~8;白色蛋殼,lanes: 9~16;M:100 bp Ladder marker。箭頭指處為不同殼色鴨隻間之明顯環帶。(黃等,2006)

5-4 田間試驗結果 5-5 DNA指紋分析 6 飼養管理及衛生防疫措施
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