(七) 緊迫基因檢測與遺傳基因體分析

　　豬第6號染色體上有鈣離子釋放管道(Calcium Release Channel, CRC)基因，若有基因缺陷，則該豬隻會產生緊迫休克死亡症狀、惡性高燒症狀，以及肌肉僵直等情況，不利於生物醫學之應用。為避免上述情形，於2006~2007年間進行賓朗豬在養畜群共計103頭之分子遺傳檢測，鈣離子釋放管道(CRC)基因型Hal-1843全為CC正常型(即台灣種豬產業界慣稱之緊迫基因AA正常型)。

　　 利用家畜種原多樣性資訊系統(Domestic Animal Diversity Information System, DADIS)於2004年所公布之swine 27個微衛星標記挑選出19個(位於15條染色體)進行試驗。針對27頭賓朗豬染色體微衛星(microsatellite)標記進行檢測，並比較族群內之差異，分析結果得知在族群內預期之平均雜和度（heterozygosity）為0.39，在所選擇之微衛星標記中，大部分皆無太大變異(2.74 alleles/locus)，符合預期之族群內繁殖結果。多態性訊息含量(Polymorphism Information Content, PIC) 介於0.09到0.59，平均為0.33，顯示該豬群基因雜合度，因實驗動物用途導向之隔離選育而降低(表8)。

　　 並將21頭賓朗豬與18頭花斑豬與55頭蘭嶼豬個體，同樣以染色體微衛星標記進行檢測親緣關係。以MSA軟體分析聚合酶鏈鎖反應產物，並以POSA(proportion of shared alleles)估算公式計算個體間遺傳距離，所得遺傳距離矩陣數據，再以MEGA4軟體繪製樹型架構(圖5)。若以族群為單位，使用Cavalli-Sforza and Edwards(1967)的遺傳距離計算方式，計算賓朗豬、花斑豬與蘭嶼豬間的相對關係，可得數值為0.238∼0.456，賓朗豬與花斑豬、蘭嶼豬的受測群間遺傳距離分別為0.238與0.391，說明這三種小型豬選育過程之緊密的遺傳關連(蘭嶼豬→花斑豬→賓朗豬)。樹型架構中21頭賓朗豬因隔離選育自成一個類群，其中尚包括15頭花斑豬，說明賓朗豬育成自花斑豬白色後裔的親緣關係。




圖5.賓朗豬、畜試花斑豬與蘭嶼豬之親緣關係(Neighbor joining樹型架構)。