一、

疾病種類不容易診斷或與其他疾病併發，造成診斷困難；

二、

外科手術之後的病牛恢復困難；

三、

手術施行的困難度，包括器械、助手及技術等。但是，牛隻在現場有時候確實需要予以施行外科手術或是配合內科方式，有效的治療各種疾病。以下僅介紹各種現場可以施行手術治療的外科疾病種類，以供參考。

臍部殘餘組織，包括發炎腫大的擠尿管、擠靜脈或擠部膜傷病1士等，傷碘溶液噴灑3至4次，一般10至14天後可以拆除皮膚傷口縫線，術後的小牛之預後情形均良好。

二、第四胃異位

　　母牛於分娩後或其他時間，若因低血鈣、創傷性蜂巢胃炎、子宮蓄膿或內膜炎、乳房炎等原因，造成牛隻食慾不佳、胃腸道自需動功能低下，致使第四胃蓄積氣體，並從瘤胃右下方移向瘤胃左下方，最後嚴重鼓脹並夾於左側腹壁與瘤胃之間，導致母牛乳量下降、食慾減退及營養失調之狀態，稱之為第四胃左側異位；有時則會向右移位而夾於右側腹壁與肝臟或結腸之間，稱為第四胃右側異位。現場牛隻多發生左側異位，右側異位則較少。有第四胃異位的牛隻其症狀包括：在產後約一週左右突然乳量下降，此為症狀最先出現者；之後可觀察到病牛食慾減退、拒食飼料及TMR，但一般只有單純異位牛隻(即無其他疾病如子宮蓄膜或創傷性第二胃炎)會斷斷續續地或選擇性地採食乾草，偶而仍可見到有反芻。有時候給予乳熱及自同病治療的藥物如鈣劑及葡萄糖後，食慾會稍稍改善，但經過一、二天以後，病牛食慾又會明顯減退。罹患第四胃異位牛隻的排糞量少，呈糊狀或泥狀，病牛在發生異位一週後開始明顯消瘦。
　　診斷第四胃異位需要依靠叩診病牛胸側以及腹脅部，注意聽診有無高調金屬音的出現。治療則建議施行外科手術如右脇腹大網膜固定術，此法可用於幾乎所有的病例，其優點為牛隻站立進行手術，且不直接縫合於第四胃上，所需要之人手少，效果甚佳且復發率低。另外也可用經皮膚之第四胃固定術，其優點為便宜、快速、不必切開腹壁，但最困難的是手術者必須能由外部正確的確定第四胃的位置，否則易造成失敗。
　　除了外科手術治療之外，靜脈點滴輸液治療二至三天也對病牛非常重要，包括：

　1.鈣劑：譬如維畜鈣(200cc)、高化鈣(500cc)、喜鈣磷(500cc)、卡爾奉(200cc)等。
　2.葡萄糖：需要50%濃度的葡萄糖1000cc。
　3.綜合維他命：包括美極會(200cc)。
　4.腸胃蠕動劑。

三、剖腹產（帝王切開術）

　　母牛常因本身或是子宮內小牛的因素而造成難產，如產道未完全張開、不可回復的子宮捻轉、胎兒畸形以及小牛胎位不正等，通常正確的時機且良好的助產技術才可以幫助母牛順利主產。一般建議，助產20至30分鐘30分鐘無效後，則必須考慮馬上要進行剖腹產，以維護胎兒生命或是保障母牛的身體狀況。助產時間過久或是助產方法失當通常會造成小牛死亡，以及母牛骨盆腔神經或其他運動器官傷害，導致產後倒臥不起。
　　手術之前須要給予母牛的健康狀況進行評估，若有脫水及體力衰弱，則應進行適當之藥物靜脈注射。手術可以於牛舍以頸夾固定後施行，手術部位需要仔細剃毛、清洗及消毒。麻醉術部以後，於左腹部皮膚做一約25cm之切創，再切開肌肉層與腹膜；連著小牛蹄部、取出部份子宮組織，順著子宮角大彎處切開子宮，以產科鍊固定胎兒蹄部關節後，取出胎兒。接著縫合子宮、肌肉及皮膚。術後的母牛可以給予之前提到類似治療第四胃異位的藥物點滴補充，傷口每日以優碘溶液噴灑3至4次，一般10至14天後可以拆除皮膚傷口縫線。

四、眼癌及眼球摘除

　　牛常發生眼部的腫瘤為鱗狀細胞癌，一般又稱為眼癌，病變可出現於眼球各部位和其附屬物，但以結膜、角膜和上、下眼皮或是第三眼臉邊緣較常發生。腫瘤外形通常呈現微凸，白色至粉紅色、有卵圓形或花椰菜似的表面。腫瘤一般可見約1至2公分大小，但若是體積增大，則會造成眼睛疼痛及感染機率增加，若不經適當治療，則會引起眼睛角膜結膜發炎，嚴重者會有視力喪失。一般建議發現母牛眼球有鱗狀細胞癌，立即施行手術摘除病變組織，可以維護眼球健康。
　　但若眼睛罹患嚴重腫瘤或有瀰漫性眼球發炎的感染狀況，病情已經擴張蔓延出眼球之外，亦或是有嚴重的創傷深及整個眼球與眼眶結構，則會使用眼眶剜除術摘除整個眼球。摘除一個眼球的牛隻不影響其每日的採食，泌乳或其他繁殖行為，術後之健康情形多屬良好。