（七）微衛星遺傳標記分析

　　利用10組自菜鴨基因組DNA篩選之微衛星標記(Hsiao et al.,2008)針對G9之30隻黑色番鴨個體DNA進行微衛星型遺傳標記分析，結果如表14所示。10組標記中共有4組標記在雞(Gallus gallus)染色體上具有直系同源基因座；於鴨(Anas platyrhynchos)基因組DNA，10組標記分屬不同scaffold，另進行連鎖不平衡(linkage disequilibrium)分析，10組標記分屬不同synteny group，顯示此10組微衛星標記應可用於黑色番鴨之遺傳分析。分析結果共觀測到31個交替基因，平均每個基因座具有3.1個交替基因(2~6 個交替基因)，其觀測異質度(Observed heterozygosity)介於0.133到0.724，平均為0.472，而期望異質度(Expected heterozygosity)介於0.127到0.695，平均為0.513，結果顯示觀測異質度和期望異質度差異不大，顯示此一族群尚未有近親衰退之虞，但哈溫平衡測試有一組達顯著差異仍須多加注意。另外平均每個基因座只有3.1個交替基因，可能與使用菜鴨微衛星標記有關，換言之即可用於黑色番鴨之菜鴨微衛星標記，其基因座可能位於序列較一致(consensus)的位置。

表14. 黑色番鴨之微衛星型遺傳標記分析