（三）遺傳基因體分析

　　林等（2009）依聯合國糧農組織（Food and Agriculture Organization）建議使用之山羊微衛星標記組，以其中12組山羊微衛星標記分析40頭本品系個體之DNA，其中除ETH10微衛星標記所檢測的基因型在所有檢測個體皆為單型外，其它11組微衛星標記皆有多態型的基因型。具多態型的微衛星標記組共檢測到42個alleles，平均每個基因座具有3.8個對偶基因（2~6 個 alleles），其觀測異質度介於0.26到0.71，平均為0.48，期望異質度介於0.36 到0.67，平均為0.50，而多態性訊息含量（polymorphism information content, PIC）平均為0.43。該試驗所選用之12組微衛星標記組中有10組呈現非高多態性資訊（PIC < 0.5），且有1組微衛星標記（ETH10）在所有檢測樣品僅出單一等位基因型（表 2）。恆春分所自民國76年後即未曾進行臺灣黑山羊之引種工作，顯示本品系族群之遺傳歧異度仍有提升之空間。

表2. 臺灣黑山羊恆春品系微衛星型遺傳標記分析

＊PIC：多態性訊息含量（polymorphism information content）。
Polymorphic markers were highly informative （PIC > 0.50）, reasonably informative
（0.50 > PIC > 0.25）, and slightly informative （PIC < 0.25）.
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　（林等，2009）