（一）遺傳資訊鑑定

　１. 粒線體 DNA 片段型鑑別
　　　以限制(酉每) Bgl II、Ecor I、Ecor V 及 Hind III 分切臺灣黑山羊之粒線體DNA，分別切為2個、3個、1個及3個DNA片段，並利用醋酸纖維膜電泳法鑑別臺灣黑山羊紅血球酵素型中6-磷酸葡萄酸鹽去氫(酉每)型（6-phosphogluconate dehydrogenase, PGD）及磷酸六碳醣異構(酉每)型（phosphohexose isomerase, PHI）之遺傳型（張等，1995），結果所有受檢黑山羊之PGD及PHI均無變異。前者為AA型、後者為BB型，顯示族群之純合度極高（張等，1994）。

　２. CRC 基因檢測
　　　鈣離子釋放管道（calcium release channel, CRC）基因在豬基因定位上已被確認為豬緊迫基因，其突變基因會影響種母豬的初產日齡和再次配種受孕之能力。在其已知的15,015bp的核甘酸序列上，第1,843個核甘酸若為T者則為CRC突變基因；若為C則為CRC正常基因。林等（2002）檢測68頭本品系山羊CRC基因，經由3% agarose gel電泳確定各樣本使用試驗引子經PCR反應後之PCR產物約為67bp，復將此產物經由HhaI作用分切後再經電泳分析，結果顯示僅有一頭母羊有33/34bp及67bp位置各一條環帶之分切型，判定該母羊應為緊迫敏感基因之雜合子，至於其他個體則均為33/34bp之分切型。由試驗得知，本品系族群CRC基因之特定核甘酸上亦會有突變之情況發生，同時顯示CRC基因第1,843鹼基具有低突變之特性。