(一)飼養管理
1.飼養管理之主要流程：
初生系統登記→系譜編號秤重→育雛期（0~5週）→6週秤重→生長期（6~9週）→10週秤重→育成期（10週~產蛋5﹪）→上籠（14週）→產蛋紀錄→26週第一次人工授精→27週第一次入孵→28週第2次入孵→29週第2次人工授精與入孵→第32週第3次人工授精與入孵→40週產蛋紀錄結束→44週選種→46週配種→48週種蛋收集→入孵→52週產生新世代。
(鴨隻1∼2週巴達利式保溫育雛，2∼5週移高床網狀育雛，6∼13週平飼飼養，14週齡以後以籠飼飼養，菜鴨各期之飼料配方如表19.)
2.育雛期飼養管理（0∼5週）
(1) 小鴨孵化後，先雌雄鑑別，並依系譜掛號，秤初生重。
(2) 小鴨入巴達利式保溫育雛器先給溫95℉及點引導燈。
(3) 保溫設定部分第一週為30~34℃，第二週為28~30℃，第三週為24~28℃，夏季需保溫1~2週，冬季氣候寒冷時應保溫3~4週。
(4) 第一天不給飼料，先給水，水中添加維生素預混料，第二天起再給予育雛料。
(5) 第四週移高床網狀育雛欄，給水給料，並於翅膀掛上羽號。
3.生長期飼養管理（6週~9週齡）
(1) 第六週秤體重，移平飼鴨舍。
(2) 6~9週齡給予小鴨料，飼料及飲水任食。
(3) 羽毛生長階段為預防啄羽發生，應調整飼養密度，隨時注意鴨隻的健康及生長狀況。
4.育成期飼養管理（10週∼產蛋5﹪）
(1) 第10週秤體重。
(2) 第10週∼14週給予中鴨料，第14週齡至母鴨初產蛋達5％，飼育大鴨料，飼料及飲水皆任飼。
(3) 第12~14週齡由平飼鴨舍移籠飼鴨舍，公母分開飼養。
5.產蛋期飼養管理
(1) 母鴨上籠後大約在第15週逐漸開始產蛋，每隻產蛋母鴨即秤初產體重，初產蛋重，紀錄初產日齡。並將該鴨移至最前排1號鴨欄，爾後母鴨初產亦如同秤體重、蛋重，記錄日齡，位置移至最前排2號鴨欄，依此類推，每日紀錄產蛋。
(2) 當全體母鴨群初產達5％後，開始給予蛋鴨料，飼料及飲水皆任飼。
(3) 產蛋記錄從初產至40週齡止，母鴨30週齡、40週齡秤體重，蛋重。
(4) 進入產蛋期夜間點燈之基礎光照由13小時起，日照不足以人工光照點燈補足，因各地區日照時間不同，視當地日照時數而定，如白天的光照為12小時，其不足的1個小時以電燈補足，可於天未亮前30分鐘點燈，天亮即熄燈，並於天剛暗即點另外的30分鐘電燈光照，在天亮前及天黑後補足太陽光照之不足，以後每週再額外增加15分鐘直至光照達17小時後，便維持17小時的光照時數。
6.屬間雜交測定
(1)母鴨於第26、29、32週齡時，採用10∼15隻公番鴨混合精液進行一次人工授精，每隻母鴨之受精量為0.05ml，進行一次人工授精後，各連續收集14天的蛋共三批次進行孵化作業，每隔7天進蛋一次，檢查記錄每隻母鴨種蛋之受精孵化情況。
(2)一次人工授精後紀錄各個別鴨編號及受精後日數於試驗蛋殼上，依鴨編號及受精後日數順序別貯存蛋，集蛋至第8天及第15天分別進行第一次與第二次入孵。
(3)試驗鴨蛋入孵後，分別在入孵後第7天、第26天及孵化作業中，紀錄個別鴨蛋之第7天中止蛋、第26天中止蛋、無精蛋、死籠蛋、孵化數等，彙集各項數據並計算受精後之入孵蛋數、受精蛋數、孵化小鴨數、胚胎死亡數及受精蛋最長持續天數。
7.種鴨選拔
由持續授精能力測定所收集之數據累積後，利用系譜之親屬關係資料，進行最佳線性無偏差預測值（BLUP）之統計分析，褐色菜鴨選拔品系選留受精持續性較長之個體公20隻、母60隻，配種繁殖下一代。對照品系則依Matheron and Chevalet (1977) 的方法，逢機選留個體公20隻、母60隻，均於44~46週齡時進行純系配種，於達50~52週齡孵化產生下一代，供繼續試驗使用。
8.種蛋入孵
經人工授精24小時後，收集受精蛋置放於15℃種蛋庫貯存，受精蛋分別於授精後第8及15天入孵。
9.系統孵化
褐色菜鴨純系配種後收集之種蛋，均記錄鴨編號於蛋殼上，於孵出後，依配種系譜分別掛羽號、稱重供試驗使用。
(二)衛生防疫
1.鴨舍及用具的清潔
清潔工作不但可以提供雛鴨生長最舒適的環境，更是養鴨盈虧的關鍵。從新鮮鴨蛋到進孵化室前，孵化器必需保持乾淨，並於每批孵化後清洗消毒。此後不論育雛期、生長期、育成期或產蛋期，於每期結束或鴨舍空閒時，均應徹底清洗消毒。鴨舍最好採用輪飼制度，使每一鴨舍均有淨空乾燥的機會;鴨舍的排水系統應特別注意，保持乾燥是避免疾病的最佳良方。糞便應經常處理，尤其在密飼時，糞便清除次數應增加。水槽應定期清潔，並供應乾淨的水給鴨飲用。家禽霍亂經常由於飲用污水所造成，這一點應特別注意。育雛時期，最好使用鐵絲網地面，使污水、糞便與雛鴨隔離。
2.預防疾病的傳播
從其他場所引進的中鴨或成鴨，應隔離飼養2-3星期後，確定沒有疾病發生，再予混養。儘量防止老鼠在鴨舍中出現，老鼠不但會咬死雛鴨，還會污染飼料，傳播疾病。隨時嚴禁訪客及車輛進入鴨場，很多病毒性肝炎就是由參觀人員的腳底板帶進病源體而引發的。參觀人員應做完全的消毒和換裝，尤以鞋底最為重要，出入車輛須經過消毒池，尤須注重輪胎消毒。鴨場內應避免不同的動物和家畜混雜飼養，如果飼養多種動物，最好加以隔離。
